Măng cụt là cây ưa bóng khi còn nhỏ. Đặt bầu ươm ở nơi có mái che hoặc dưới bóng râm của cây lớn, đảm bảo độ che bóng khoảng 60 - 70%. Ánh nắng trực tiếp sẽ làm cháy lá và chết cây con.
Luôn giữ cho giá thể có độ ẩm vừa phải. Tưới nước hàng ngày bằng vòi phun sương, tránh tưới quá đẫm gây úng rễ.

Hạt sẽ bắt đầu nảy mầm sau khoảng 2 - 4 tuần.
Cần giữ trong vườn ươm ít nhất 2 - 3 năm cho đến khi cây cao khoảng 60 - 80 cm và đủ cứng cáp mới có thể đem trồng ra vườn.
Sau khoảng 2 - 3 tháng, có thể bắt đầu bón phân NPK pha loãng với nồng độ rất thấp (1/4 so với bình thường) để kích thích cây phát triển.