Nhiệt độ
Cây sen sinh trưởng tốt nhất trong điều kiện nhiệt độ ấm của vùng nhiệt đới, với nhiệt độ trung bình là 25°C.
Ở 15°C hầu như hạt không nảy mầm, ở 2°C thời gian nảy mầm là 9 ngày. Từ 25 - 40°C thời gian nảy mầm là 6 ngày, 40°C xuất hiện triệu chứng mầm chết do nóng.
Sen sinh trưởng chậm ở vùng bị sương giá do cây rất nhạy cảm với nhiệt độ lạnh. Tuy nhiên củ sen có đặc tính ngủ nghỉ qua đông nhằm giúp cây sen tồn tại.
Ánh sáng
Sen là loài cây ưa sáng, đặc biệt là ánh nắng mặt trời trực tiếp.
Sen chỉ ưa mọc ở những nơi ấm áp và cần ít nhất 6 giờ ánh sáng mỗi ngày. Việc phân hóa củ bị kích ứng khi cường độ ánh sáng giảm và nhiệt độ thấp.
Độ ẩm
Độ ẩm không khí từ 55 - 65% thuận lợi cho cây sen sinh trưởng, phát triển tốt.
Vào thời điểm có cường độ ánh sáng yếu, độ ẩm cao, cây thường bị nhiễm bệnh, nên cần giữ độ ẩm dưới 70% ban ngày và dưới 85% vào ban đêm. Tùy vào từng giai đoạn sinh trưởng và phát triển của cây, cần có nhu cầu về độ ẩm khác nhau.
Cây con khi mới trồng cần độ ẩm không khí khoảng 90 - 95%.
Khi cây lớn dần (4 - 6 tuần), nhu cầu về độ ẩm thấp hơn, khoảng 80%.
Giai đoạn ra hoa, cây cần độ ẩm khoảng 70%.
Giai đoạn thu hoạch, cây cần độ ẩm vừa phải để tránh nước đọng trên các vết cắt, gây thối hoa và phát sinh sâu bệnh.